Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSTPIP1O43586 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms