Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP290O15078 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP290O15078 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP290O15078 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP290O15078 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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