Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms