Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8JA6NMD2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms