Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIT2A6NDA9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms