Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP3K4Q9Y6R4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms