Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHMP3Q9Y3E7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms