Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms