Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HHLA3Q9XRX5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms