Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU3Q9UQ49 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms