Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TTC7AQ9ULT0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms