Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCF2Q9UG63 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms