Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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