Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms