Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms