Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIN1Q9NXP7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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