Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms