Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms