Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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