Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms