Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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