Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms