Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms