Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms