Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms