Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms