Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VAT1Q99536 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms