Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms