Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NSMCE2Q96MF7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms