Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms