Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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