Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms