Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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UBE2E3Q969T4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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UBE2E3Q969T4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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UBE2E3Q969T4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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UBE2E3Q969T4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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