Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms