Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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