Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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