Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXO39Q8N4B4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms