Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms