Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms