Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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ZBED9Q6R2W3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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ZBED9Q6R2W3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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ZBED9Q6R2W3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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ZBED9Q6R2W3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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ZBED9Q6R2W3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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ZBED9Q6R2W3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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ZBED9Q6R2W3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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ZBED9Q6R2W3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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