Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q6P435 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q6P435 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q6P435 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q6P435 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q6P435 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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