Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM164Q5U3C3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms