Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAL1Q4LDG9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms