Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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