Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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