Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC37Q16543 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDC37Q16543 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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