Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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CNGA3Q16281 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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CNGA3Q16281 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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CNGA3Q16281 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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CNGA3Q16281 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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CNGA3Q16281 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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CNGA3Q16281 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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