Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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