Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NEDD8Q15843 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NEDD8Q15843 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NEDD8Q15843 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NEDD8Q15843 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
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