Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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